《星际之门：亚特兰蒂斯》是《星际之门》系列的重要衍生作品，故事承接《星际之门：SG-1》第七季的剧情。在奥尼尔将军使用南极前哨站的古人武器摧毁Goa'uld舰队后，地球各国意识到古人科技的巨大潜力，联合成立南极联盟，共同研究前哨站中的Ancient技术。通过破译古人数据库，科学家们发现了一个通往遥远飞马座星系的星际之门地址。一支由科学家、军人和医生组成的国际探险队，在伊丽莎白·韦尔博士和约翰·谢泼德少校的带领下，穿越星际之门来到飞马座星系，发现了传说中的亚特兰蒂斯城——一座由古人建造的宏伟水上城市。然而，探险队很快发现他们并非这片星空的唯一居民。一种名为“幽灵”的恐怖外星种族统治着飞马座星系，他们以人类为食，拥有强大的生物科技和蜂巢舰队。探险队必须在资源有限、孤立无援的情况下，利用亚特兰蒂斯城的古人科技，与幽灵展开持久对抗，同时探索这座失落之城隐藏的秘密，并努力寻找返回地球的方法。本剧融合了科幻冒险、团队合作与生存挑战，展现了人类在未知宇宙中求生的勇气与智慧。