公元2202年，距离大和号完成那场单程16万8000光年、通往伊斯坎达尔的壮烈航海已过去三年。在“宇宙恢复系统”的运作下，地球重新披上蓝色外衣，并与曾经的宿敌卡米拉斯帝国建立了脆弱的和平。然而，和平的表象之下，新的阴影正在宇宙深处蔓延——加特兰蒂斯帝国以压倒性的武力向地球宣战，其背后隐藏着关于“爱”与“永恒”的残酷真相。古代进与森雪等人被重新召集，大和号在加藤等人的努力下完成现代化改装，搭载着波动炮再度升空。面对远超卡米拉斯的强敌，以及内部关于战斗与和平路线的分歧，船员们必须直面过去的伤痛与未来的抉择。与此同时，大和号所承载的不仅是武器与科技，更是一份跨越种族与时空的思念。随着战局升级，古代进逐渐发现，这场战争的核心竟与地球、卡米拉斯乃至整个银河的起源紧密相连。在爱与牺牲交织的宇宙舞台上，大和号的最终航程将揭开“爱的战士们”这一称号的真正含义，而人类能否在毁灭的宿命中找到新的希望，一切取决于船员们心中那份不灭的信念。