《扩张少女系三重奏》的故事始于2016年，首都圈上空骤然浮现巨大茧状物体，人们将其命名为“Phenomenon”。其正体不明，但被吸入内部的人类会陷入疯狂。少女们因各自的原因与这一现象产生交集，被迫投身于对抗异变的战斗之中。作品融合了科幻战斗与少女日常，既有紧张的危机时刻，也细腻刻画了角色之间的情感碰撞。随着谜团逐步揭开，她们不仅需要面对外部的威胁，更要直面内心的迷茫与恐惧，在绝望中寻找希望，用彼此的信任与勇气书写属于自己的蜕变篇章。