特别篇承袭TV动画主线，以君主·埃尔梅罗二世（韦伯·维尔维特）与格蕾为中心，讲述时钟塔内部暗流涌动的隐秘事件。当“魔眼收集列车”的传说再次被提及，二世接到一项看似寻常却暗藏杀机的委托，而格蕾体内沉睡的谜之力量也随之波动。为了查明真相，二世不得不直面自己作为“君主”的责任与过往阴影，在诡谲的魔术陷阱和人性博弈中步步为营。本特别篇在保留原作严谨设定与华丽魔术战斗的基础上，进一步深化人物羁绊。面对继承亚德身份的重负、与圣杯战争旧识的纠葛，以及时钟塔权贵间的排挤，二世以智慧与信念破局。格蕾则在战斗中逐渐理解自己兵器的宿命，寻找成为“人”的道路。谜底揭晓时，那趟列车驶向的不只是目的地，更是二人共同选择的未来。经典角色悉数登场，全新冲突考验着每个人的觉悟，为事件簿系列再添浓墨重彩的一笔。