在超古代时期，地球文明高度发达，但宇宙联盟奥可夫·马纳夫认定人类终将破坏宇宙和平，于是发动毁灭性攻击，彻底抹去了旧文明。时光流转至现代，人类重筑文明，而宇宙联盟的阴影再次笼罩地球。当未知的敌人驾驶巨大怪兽与机械军团降临，平凡少年少女们体内潜藏的超古代基因开始苏醒。他们正是被选中的十二位星神战士，分别觉醒为狮、鹿、鹰、龙等星座形态，能够召唤并驾驶巨大的守护机器人“超星神”。随着战斗升级，战士们逐渐发现彼此间的前世羁绊，以及宇宙联盟背后更深的阴谋。他们必须跨越分歧、信任彼此，将十二份力量合而为一，唤醒传说中足以拯救世界的最终超星神。在浩渺星河下，这场关乎人类存亡的战斗，既是宿命的轮回，也是新未来的起点。