《飛常日誌》以香港國際機場為主要舞台，透過機場中央控制中心值班經理楊尚偉的視角，呈現航空業前線人員的日常工作與人生百態。楊尚偉年少時見證機場從啟德遷往赤鱲角的歷史時刻，廿五年後，他已在機場中央控制中心擔任值班經理，負責監察整個機場運作，確保航班、旅客及地勤服務順暢無阻。港灣航空駐機場主管張若玲與楊尚偉因工作立場不同而頻繁交鋒，二人從誤解與摩擦中逐漸建立默契，共同應對航班延誤、旅客糾紛、天氣突變及突發事故。劇集圍繞機場各部門員工的協作與成長，刻畫他們在高壓環境下堅守崗位、互相扶持的專業精神，並交織親情、友情與愛情線，展現繁忙空港背後的人情溫度與香港航空業的時代變遷。