本作为经典超级机器人动画《魔神Z》的续篇，故事紧接前作结局。在地狱博士败亡后，潜伏于地底的迈锡尼帝国崛起，企图以战斗兽征服地面世界。光子力研究所尚未从和平中恢复，便遭到突如其来的攻击，研究所陷入空前危机。危急时刻，兜甲儿驾驶由父亲兜剑造研发的新机体“大魔神”登场。与魔神Z不同，大魔神拥有更强大的出力与武装，以压倒性力量轻松击退来犯之敌。然而，这只是迈锡尼帝国试探性的前奏。随着帝国真正统帅暗黑大将军登场，甲儿不仅要面对更强悍的战斗兽，还要揭开大魔神背后隐藏的秘密。本作进一步扩展了机器人动画的格局，战斗场面更为激烈，机体设计更具力量感。甲儿从热血少年成长为独当一面的战士，与同伴们共同守护和平，书写超级机器人的全新传奇。